Sinteza oligonucleotide ADN
- lungime de pana la 200 bp
- domeniu standard (40 nmol, 200 nmol and 1 μmol)
- domeniu larg de modificari
- fara saruri
- posibilitate de purificare HPLC si PAGE
| Fluorofory | Ex. | Em. | Optiune |
| Cy3TM | 550 | 564 | ATTO 542, DY-530 |
| Cy5TM | 648 | 668 | ATTO 647N |
| FAM | 495 | 520 | DY-490, DY-495 |
| HEX | 538 | 555 | CAL Fluor® Orange 560 |
| JOE | 529 | 555 | CALFluor® Gold 540, Orange 560 |
| ROX | 588 | 608 | ATTO Rho 101 |
| TAMRA | 559 | 583 | CAL Fluor® Red 590, DY-560 |
| TETTM | 522 | 539 | CAL Fluor® Gold 540 |
| Texas Red® | 596 | 613 | CALFluor® Red 610, ATTO Rho101 |
Sinteza oligonucleotide ARN
- lungime de pana la 60 bp
- domeniu standard (40 nmol, 200 nmol si 1 μmol)
Sinteza oligonucleotide LNA
Locked nucleic acids (LNA) sunt nucleotide ARN modificate ce contin o jumatate zaharica ciclica "blocata". Puntea dintre oxigenul 2' si carbonul 4' "blocheaza" riboza in conformatia 3'-endo. Nucleotidele LNA pot fi amestecate cu ADN sau ARN rezidual in oligonucleotide. Oligonucleotidele LNA modificate prezinta o afinitate inalta catre hibridizare ADN complementar sau ARN.
De ce se utilizeaza LNA?
- acord fin al temperaturilor de topire
- afinitate avansata de hibridizare la lungimi scurte
- raport semnal zgomot imbunatatit in testele qPCR
- cuantificare mai precisa a genelor si separare alelica
- detectie mai buna a neconcordantelor mononucleotidelor
- rezistenta endo- si exonucleaza crescuta
Aplicatii
- Aplicatii qPCR/PCR inclusiv multiplex PCR
- inactivare a genelor cu oligonucleotide antisens LNA
- dezvoltare medicamente antisens (non-toxic)
- discriminare alele
- analize microarray
- analiza expresie gene
Indrumari Design
- nu recomandam mai mult de 4 baze consecutive LNA
- bazele LNA nu trebuie pozitionate la terminalul 3´sau aproape de acesta
- incercati sa evitati intinderi 3 +G si 3 +C
- continutul de GC trebuie sa fie intre 30-60 %
- un numar mare de LNA (de ex. 16 sau mai multe) creste riscul de autohibridizare
- o baza LNA creste Tm cu 2-6°C (DNA) si 3-9°C (RNA)
- o baza LNA pozitionata la terminatia 5´ nu influenteaza Tm
Cum se comanda
- LNA se marcheaza in secventa cu + (e.g. +A, +C, +G, +T)
- disponibile in toate domeniile standard (40 nmol, 200 nmol si 1 μmol)
- compatibile cu toata gama noastra de modificari