Synteza oligonukleotydów DNA
- długość do 200 pz
- skala standardowa (40 nmol, 200 nmol oraz 1 μmol)
- szeroki zakres modyfikacji
- oczyszczony metodą wysalania
- możliwość oczyszczania metodą HPLC i PAGE
| Fluorofory | Ex. | Em. | Opcja |
| Cy3TM | 550 | 564 | ATTO 542, DY-530 |
| Cy5TM | 648 | 668 | ATTO 647N |
| FAM | 495 | 520 | DY-490, DY-495 |
| HEX | 538 | 555 | CAL Fluor® Orange 560 |
| JOE | 529 | 555 | CALFluor® Gold 540, Orange 560 |
| ROX | 588 | 608 | ATTO Rho 101 |
| TAMRA | 559 | 583 | CAL Fluor® Red 590, DY-560 |
| TETTM | 522 | 539 | CAL Fluor® Gold 540 |
| Texas Red® | 596 | 613 | CALFluor® Red 610, ATTO Rho101 |
Synteza oligonukleotydów Synteza oligonukleotydów RNA
- długość do 60 pz
- skala standardowa (40 nmol, 200 nmol oraz 1 μmol)
Synteza oligonukleotydów LNA
Zablokowane kwasy nukleinowe (LNA) są zmodyfikowanymi nukleotydami RNA zawierającymi „zablokowaną” bicykliczną resztę cukrową. Most pomiędzy 2 'tlenem i 4' węglem „blokuje” rybozę w konformacji 3'-endo. Nukleotydy LNA można mieszać z resztami DNA lub RNA w oligonukleotydzie. Zmodyfikowane oligosy LNA wykazują zwiększone powinowactwo do hybrydyzacji względem komplementarnego DNA lub RNA.
Dlaczego warto korzystać z LNA?
- regulacja temperatury topnienia
- zwiększone powinowactwo do hybrydyzacji przy krótszej długości
- ulepszony stosunek sygnału do szumu w testach qPCR
- dokładniejsze oznaczanie genów i dyskryminacja alleliczna
- lepsze wykrywanie niedopasowania pojedynczych nukleotydów
- zwiększona odporność na endo- i egzonukleazę
Zastosowanie
- Aplikacje qPCR/PCR, w tym multipleksowa reakcja PCR
- wyciszanie genów za pomocą antysensownych oligonukleotydów LNA (łatwe wprowadzanie do komórek)
- opracowywanie leków antysensownych (nietoksyczne)
- dyskryminacja alleli
- analiza mikromacierzy
- analiza ekspresji genów
Wytyczne dotyczące projektowania
- nie zalecamy więcej niż 4 kolejnych zasad LNA
- Zasady LNA nie powinny być ustawione na końcu 3' lub w pobliżu końca 3'
- staraj się unikać odcinków 3 + G i 3 + C
- Zawartość GC powinna wynosić od 30 do 60%
- większa liczba LNA (np. 16 i więcej) zwiększa ryzyko zapętlenia (autohybrydyzacji)
- jedna zasada LNA zwiększa Tm o 2-6 °C (DNA) i 3-9 °C (RNA)
- jedna zasada LNA umieszczona na końcu 5' nie wpłynie na Tm
Zamawianie oligonukleotydów
- LNA są oznaczone w sekwencji za pomocą + (e.g. +A, +C, +G, +T)
- dostępne we wszystkich standardowych skalach (40 nmol, 200 nmol oraz 1 μmol)
- w pełni kompatybilny z naszą szeroką gamą modyfikacji