DNS Oligonukleotid szintézis
- akár 200 bp hosszúságban
- standard kiindulási mennyiségek (40 nmol, 200 nmol és 1 μmol)
- a módosítások széles választékával
- só-tisztított
- lehetőség HPLC vagy PAGE tisztításra
| Fluorofory | Ex. | Em. | Alternativa |
| Cy3TM | 550 | 564 | ATTO 542, DY-530 |
| Cy5TM | 648 | 668 | ATTO 647N |
| FAM | 495 | 520 | DY-490, DY-495 |
| HEX | 538 | 555 | CAL Fluor® Orange 560 |
| JOE | 529 | 555 | CALFluor® Gold 540, Orange 560 |
| ROX | 588 | 608 | ATTO Rho 101 |
| TAMRA | 559 | 583 | CAL Fluor® Red 590, DY-560 |
| TETTM | 522 | 539 | CAL Fluor® Gold 540 |
| Texas Red® | 596 | 613 | CALFluor® Red 610, ATTO Rho101 |
RNS Oligonukleotid szintézis
- akár 60 bp hosszúságban
- standard kiindulási mennyiségek (40 nmol, 200 nmol és 1 μmol)
LNS Oligonukleotid szintézis
A zárt nukleinsavak (LNS) módosított RNS nukleotidok, melyek egy "zárt" biciklikus cukor formát tartalmaznak. A 2' oxigén és 4' szén közötti híd "bezárja" a ribózt egy C2’-exo-C3’-endo konformációba. Az LNS nukleotidok DNS vagy RNS nukleotidokkal együtt alkothatnak oligonukleotidokat. Az LNS nukleotidok megnövekedett hibridizációs affinitással rendelkeznek a komplementer DNS és RNS láncok irányában.
Miért használjon LNS-t?
- az olvadáspont finomhangolásához
- megnövekedett hibridizációs affinitás a rövidebb oligonukleotidok esetében
- megnövekedett jel/zaj arány a qPCR tesztekben
- sokkal pontosabb a kvantitálás és az alléldiszkrimináció
- jobb az egyedi hibás hibridizációk detektálása
- megnövekedett endo- és exonukleáz rezisztencia
Felhasználási területek
- qPCR/PCR mérések, beleértve a multiplex PCR reakciókat is
- gén csendesítés antisense LNS oligonukleotidokkal (könnyen bejut a sejtbe)
- antisense gyógyszer-fejlesztés (nem toxikus)
- alléldiszkrimináció
- microarray analízis
- génexpresszió analízis
Tervezési segédlet
- maximum 4 LNS bázis kapcsolását javasoljuk egymás után
- nem lehetnek LNS bázisok a 3' végen, vagy annak közelében
- kerüljék el 3 db +G vagy 3 db +C beépítését egymás után
- A GC-arány 30-60% között legyen
- a nagyobb számú LNS (> 16 db) megnöveli a saját-hibridizáció valószínűségét
- egyetlen LNS bázis 2-6 °C-kal (DNS) vagy 3-9 °C-kal (RNS) növeli meg a Tm értékét
- egyetlen LNS bázis az 5' végen nem befolyásolja a Tm értékét
Rendelési információk
- a szekvenciában meg kell jelölni az LNS bázisokat (pl.: +A, +C, +G, +T)
- minden standard kiindulási koncentrációban elérhetők (40 nmol, 200 nmol és 1 μmol)
- az általunk kínált módosítások széles választékával teljes mértékben kompatibilisek